Заповедник расположен в центральной части Средне-Сибирского плоскогорья в междуречье Подкаменной Тунгуски и ее правого притока реки Чуни. Он был образован в 1995 г. для изучения последствий падения неустановленного космического объекта, вошедшего в историю как Тунгусский метеорит (30.06.1908г.), и сохранения местной окружающей среды в предполагаемом месте падения. Это в 70 километрах от п. Ванавара, площадь охранной зоны – 20,2 тысячи гектаров.
Заповедник располагается на Сибирской платформе, именуемой Тунгусской впадиной, расчлененной долинами рек. Тайга занимает около 70% охраняемой зоны, остальная часть – болотистая местность.
На сопредельных к заповеднику территориях, и частично в нем может развиваться экологический, познавательный и спортивный туризм, а также рыбная ловля.