То место издавна было торговым. Во времена ханского правления на территории Гостиного двора (Кремлевская, 2) или недалеко от него, стояла колония-поселение торговцев и ремесленников, выходцев из Бухары. Поселение было обнесено деревянным частоколом, а с 1500 года, после набега ногайских мурз на Казань, появились вокруг него по велению казанского хана Абдул-Латифа валы со рвами по обеим сторонам.
В 1530 году колонию бухарцев, как все посадские поселения, обнесли высокими острожными стенами, которые хан Сафа-Гирей выстроил в преддверии ожидаемой войны с Москвой. Позже, с уходом русских войск и завершением строительства оборонительных укреплений вокруг Казани, валы Бухарского посада были срыты, а рвы за ненадобностью засыпаны. Большим разрушениям подвергся Бухарский посад во время осады Казани полками Ивана Грозного. После взятия города новые власти вернули на прежнее место два базара: нижний - Ташаяк, прямо под кремлем, и верхний, бывший бухарский.
В конце XVI века в Гостином дворе насчитывалось около 635 торговых точек. А на исходе XVII столетия началось в нем каменное строительство. В 1695 году на новых главных воротах Гостиного двора была освящена церковь во имя Алексея Божия Человека. К 1739 году уже все его постройки были из камня. Вот как писал о Гостином дворе член-корреспондент Санкт-Петербургской Академии наук Петр Иванович Рычков в 1767 году: «Гостиной двор каменной, на котором в верху таможня каменная ж; внутри однаго двора ряды: Суконной, 2 Мелочной, 3 Сибирской железной. К сему ж гостиному двору приделаны деревянные ряды». Помимо каземата в помещениях Гостиного двора располагалась гарнизонная канцелярия, а над ней трактир.
Во время пугачевского нашествия Гостиный двор весомо пострадал от пожара и император Павел I в бытность свою в Казани в 1798 году даровал городу беспроцентную ссуду на десять лет из губернских доходов в размере 200 тысяч рублей для сооружения нового. Закладка его состоялась 25 июня 1800 года. Вскоре Воскресенская улица украсилась новым каменным двухэтажным Гостиным двором - творением архитектора Михаила Емельяновича Емельянова (1761/62 - ?). После очередного пожара в 1842 году исчезли с фасада здания величественные колонны. В начале 90-х годов XIX века в помещениях бывшего трактира расположился ломбард, а весь северо-восточный угол двора был отдан под помещения городского музея, открывшегося 6 апреля 1895 года.
После 1917 года Гостиный двор навсегда теряет свои торговые функции. В его помещениях, не занятых городским музеем, начинают располагаться разного рода конторы и учреждения. В 30-е годы северная его часть надстраивается ещё двумя верхними этажами, что сильно исказило его первоначальный облик. Ныне, после проведения реставрационных работ, здание вернуло себе близкий к первоначальному вид, однако только юго-западная его сторона в достаточной мере соответствует тому облику, который имел Гостиный двор 200 лет назад...