Крепость святой Варвары когда-то защищала юго-восточную часть города. Она находится приблизительно в 700 м от Соборной площади.
На месте, где теперь стоит крепость святой Варвары, в 1331 году флорентинцы построили крепость. Пистойцы, согласно некоторым источникам, разрушили эту крепость в 1343 году, из построек осталась только большая башня. По другим источникам, укрепления ещё стояли в конце 14 века.
Крепости довелось только раз вступать в военные действия: в середине 17 века она, как и вся Пистойя, была осаждена папскими войсками (1643). Пистойцы тогда взяли верх над противником. В 1743 году по указу Великого герцога Тосканского Леопольда II цитадель была разоружена. Затем в помещениях крепости была размещена казарма, а позднее – тюрьма. В 20 веке комплекс был отреставрирован и открыт для посетителей в 1980 году.
Крепость была построена как четырёхстороннее бастионное укрепление. Кирпичные стены укрепления имели откосы с внешней стороны. Вход в крепость вёл в центр куртины. Крепость святой Варвары была прочна и лишена излишних украшений, являя собой пример типичной военной архитектуры Козимо I.