Церковь святого Франциска была резиденцией францисканского ордена; в комплекс помимо церкви входит капелла Непорочного зачатия. Комплекс расположен между площадью piazzale San Francesco и улицей via del Prato, приблизительно в 400 м на северо-восток от Соборной площади.
Церковь, вероятно, была построена в середине 13 века. Тогда же были возведены основные постройки монастырского комплекса. Первое письменное упоминание о церкви датировано 1298 годом. В последующие века она играла важную роль в жизни города. Именно в церкви святого Франциска хоронили представителей самых знатных семей Пармы. В 15 веке велись работы по расширению церкви. Они были завершены к 1462 году. Колокольная башня была возведена между 1506 и 1523 годами.
Здание церкви имеет очень интересное расположение. Оно ориентировано так, чтобы на апсиду смотрело восходящее солнце в день зимнего солнцестояния, а лучи заходящего солнца в день летнего солнцестояния освещали бы храм через розетку главного фасада. Розетка главного портала изготовлена в 1461 году мастером Альберто да Верона. Примечательно, что диаметр окна-розетки точно соответствует старинной пармской мере длины, пармской пертике, и равен 3,27 м. 16 лучей у розетки неслучайно, согласно средневековой символике число 16 означает дом Бога.
Капелла Непорочного зачатия была построена в 16 веке на месте одной из капелл церкви по проекту архитекторов Бернардино Дзакканьи и Джанфранческо Феррари д`Аграте. Изначально в плане капеллы лежал латинский крест, но т.к. капелла разделила судьбу других помещений комплекса, т.е. стала частью городской тюрьмы, она была перестроена. Был замурован проход в капеллу из церкви, помещение было перестроено. Сейчас в плане капеллы лежит греческий крест. Именно в этой капелле вскоре после размещения в комплексе городской тюрьмы было решено организовать тюремную капеллу. Это помогло сохранить некоторые фрески 16 века работы Микеланджело Ансельми и Франческо Рондани (оба художника работали в своё время с Корреджо). От стены церкви была отделена фреска «Богоматерь с младенцем и святыми Иоанном и Франциском» и перенесена в тюремную капеллу.
С церковью святого Франциска связан любопытный факт. Некоторые исследователи полагают, что место для строительства монастырей в Средневековье выбирали вовсе не случайно. Есть предположение, что средневековые монастыри Пармы расположены в виде золотого прямоугольника. Также считается, что если провести прямую линию от изображения святого Франциска в пармском баптистерии, то она укажет как раз на церковь святого Франциска.
