Церковь святого Франциска находится в историческом центре в 400 м к юго-западу от кафедрального собора. Над главным порталом можно увидеть таблички с датами: слева 1265 – это дата основания монастыря, и справа 1274 – дата возведения церкви.
Церковь святого Франциска возведена на основе предыдущей базилики протороманского периода, от которой сохранились лишь элементы каменного декора на левой стене современного здания, под портиком и на внутренней стене апсиды. Сама церковь достаточно проста: она имеет один удлиненный неф, завершаемый апсидой со стропильными деревянными перекрытиями в позднеготическом стиле. Примерно в 1449 был возведен главный портал с резной деревянной дверью, представляющей большую ценность благодаря удивительному мастерству исполнения.
На задней части здания находится еще один портал в стиле каталанской готики, над ним расположено витражное окно-роза.
Внутри церкви в нише на левой стене можно увидеть фреску с изображением мученической казни святого Себастьяна кисти художника Джованни Тодиско (1550).
Слева от триумфальной арки, отделяющей мраморный алтарь от остального пространства церкви, находится деревянная дверь, ведущая в ризницу и украшенная растительным орнаментом. На правой стене ризницы – еще одна резная дверь, ведущая в большую залу. В зале находятся 12 панно восьмиугольной формы с изображением 12 апостолов (конец 16 – начало 17 века).
В церкви святого Франциска представляют интерес также следующие богослужебные предметы и произведения искусства:
* деревянное распятие в апсиде, удивительно реалистичное по пластике (16 век);
* гробница со скульптурным изображением Донато де Грасиса (вероятно, один из жертвователей на строительство церкви);
* полотно с изображением Богоматери с младенцем (1852);
* фреска с изображением святого Франциска Ассизского;
* фреска с изображением святой Клары во францисканских одеждах и с книгой в руке.
Слева от церкви находится высокая колокольня (конец 14 - начало 15 века) с рядом романских окошек и двумя рядами готических окон. Колокольню венчает пирамидальная крыша.