Церковь святого Филиппа Нери находится в 300 метрах на запад от кафедрального собора. Она была построена между 1647 - 1467 годами орденом кармелитов на месте старой церкви святого Фомы. Позже кармелиты перебрались в другую церковь, а этот храм перешел во владение светских правителей и был освящен именем выдающегося итальянского проповедника 16 века святого Филиппа Нери. Известно, что для возведения основания церкви были использованы каменные блоки из разрушенного древнеримского моста.
Здание церкви является уникальным в своем роде примером барочной архитектуры в Фаэнце. Ее фасад демонстрирует строгую симметрию линий и форм, и в то же время обильно украшен декоративными элементами. Поверхность фасада оживлена игрой углублений и выпуклостей, рождающейся от умелого перемежения ниш, карнизов, обломов и пилястр, которые создают захватывающие светотеневые эффекты. В то же время фактура фасада усложнена сочетанием кирпичной кладки и каменных элементов. Из кирпича выполнены основные объемы, в то время как камень использован для основания, боковых велюр в верхней части и колонн, обрамляющих центральный бифорий. Обращают на себя внимание ворота, выполненные из дерева и украшенные рельефными фигурками черепов и другими мотивами на тематику «memento mori».