Церковь Богоматери Канепанова находится на пересечении улиц via Defendente Sacchi и via Ada Negri, примерно в 700 м к востоку от Соборной площади.
В конце 15 века стали происходить чудеса около фрескового изображения Богоматери, написанного на стене дворца семейства Канепанова. К чудотворному образу стали стекаться паломники. Канепанова решили построить святилище для почитаемого изображения. Для строительства храма был приглашён архитектор Джованни Антонио Амадео. В этот период зодчий находился на вершине своей славы: он воздвиг тибурий миланского собора и был приглашён кардиналом Асканио Сфорца в Павию – руководить работами по возведению собора. Для святилища Богоматери Амадео выбрал квадратный план, как в построенной им ранее капелле Коллеоне в Бергамо. Впрочем, некоторые исследователи, несмотря на явное сходство проектов капеллы в Бергамо и святилища Богоматери Канепанова, полагают, что проект святилища Канепанова был выполнен Браманте. Фундаментом для церкви Богоматери послужил фундамент древней лангобардской церкви. Завершено строительство здания было уже во второй половине 16 века, когда рядом с церковью вырос монастырский комплекс варнавитов.