Озеро Аммер (Аммерзее) занимает 3-е место по величине в Баварии после озёр Чим и Штарнберг (из тех, что лежат исключительно в Баварии) и является самым широким после идущего на север Предальпийского озера. Территория озера считается свободной административной единицей вместе с комуннами на западном берегу до округа Лансберг-ам-Лех. Населенные пункты в округе Штарнберг расположены на восточном берегу, а также малая часть населенных пунктов на юге, где Аммер впадает в округ Вайльхайм-Шонгау. Озеро в собственности свободного государства Бавария, где государственные замки, сады и озёра находятся под управлением баварского руководства. Площадь озера составляет 47 кв. км, максимальная глубина около 80 м. В результате прогрессирующего обмеления расположенный на юге озера остров Швендель уже превратился в полуостров и когда-нибудь полностью станет берегом.
Озеро Аммер возникло, как и другие озёра Баварских Предальп, в результате таяния ледника времён ледникового периода. Озёрный бассейн, имеющий типичную языкообразную форму, в расщелине Зале вюрмского периода образовался от ледника Лойзах, который является частью Изар-Лойзахглетчера, и широко протянулся далеко на сушу из пролива Гармиш.
Около 16 000 лет назад лёд начал медленно таять и почти 14 000 лет назад полукругом образовались конечные морены, а затем и водная поверхность. Озеро протянулось в северо-южном направлении до Графрат на севере.
Возле Херршиг на северо-востоке этот язык разветвляется, образуя озеро Пильзен, которое тоже было частью целого озера. С одной стороны, причиной таких изменений послужила работа притоков, особенно Аммера на юге и Виндах на севере, которые приносили в озеро обломки горных пород, где они накапливались, в то время как, с другой стороны, биогенные осадки приводили к образованию отмелей. Обмеление продолжалось, предположительный возраст озера Аммер насчитывает около 20 000 лет.
