По легенде, название города было сложено из имен индейского вождя Гуаяс и его жены Киль, которые предпочли смерть жизни под испанским владычеством. Гуаякиль был основан в 1534 году Франциско де Орельяна на склонах холма Санта-Анна. С вершины горы до сих пор грозно взирают пушки, в древние времена защищавшие побережье от набегов пиратов, а на склонах сохранились дома, состоящие из нескольких уровней и оборудованные укрепленной стеной со стороны реки. В окрестностях города находятся руины древних поселений индейцев вальдивия, мачалилья, чоррера, гуангала и мантенья. Залив Гуаякиль, городская река, памятники, музеи, парки и ночные заведения составляют очарование этого прибрежного города.