Также недалеко от столицы и всего в 5 км от Хойя-де-Серен лежит муниципалитет Сан-Андрес, где плодородная почва одноименной долины скрывает немало исторических загадок. Комплекс Сан-Андрес (открыт с четверга по воскресенье, с 9.00 до 16.00; вход - $3) - один из крупнейших участков доколумбовых культур в Сальвадоре, первоначально охватывавший более трех квадратных километров. По оценкам ученых, в позднеклассический период майя (650-900 гг. н. э.), когда город достиг своего расцвета, здесь проживало около 12 тысяч человек, а сам он являлся столицей плодородной долины Сапотитан. В настоящее время вскрыта лишь малая часть сооружений города, среди которых особенно выделяется так называемый Акрополь, или Южная площадь, - мощная каменная платформа, на которой установлено множество пирамид и башенок. Также интересны "Структура I" на южном краю площади (предположительно храм - в его северной части обнаружен алтарь), кварталы знати по северной и западной сторонам Акрополя; погребальные пирамиды по восточному краю площади, так называемая Рыночная площадь несколько севернее, а также только что открытая пирамида "Структура V" на восточном краю этой площади. Небольшой музей содержит точную модель этого древнего города и неплохую экспозицию древних артефактов.