В конце тридцатых годов XVIII века началось строительство новой магистрали от Кирочной до Разъезжей улицы. Позже эта большая магистраль распалась на две отдельные улицы – ныне это улица Марата и Маяковская улица. Улица Марата в то время называлась Преображенской, поскольку неподалеку от Кирочной улицы размещались казармы Преображенского полка. Эта дорога соединяла Невский проспект с Разъезжей улицей. Дальше Разъезжей улица называлась уже Семеновской (в этом районе размещался Семеновский полк).
История Владимирского собора Петербурга начиналась как раз на улице Марата – именно здесь, на участке комиссара главной дворцовой канцелярии Ф. Якимова, в середине XVIII века была открыта временная церковь – прообраз будущего собора. В восьмидесятые годы этого же столетия был построен двухэтажный дом для А.Н. Радищева и его семьи. В этом доме он написал свое знаменитое произведение «Путешествие из Петербурга в Москву».
В первой половине XIX века на Грязной улице было построено здание для Ямского рынка, а также Никольская единоверческая церковь. Дом № 25 известен тем, что здесь жила сестра А.С. Пушкина Ольга и его няня Арина Родионовна. Также в середине XIX века на этой улице проживала семья известного русского архитектора В.П. Стасова. В это же время Грязная улица была соединена с Семеновской. В конце пятидесятых годов этого же столетия улицу переименовали в Николаевскую.
Во второй половине XIX века на Николаевской улице строились доходные дома и торговые лавки. Дом № 11 примечателен тем, что в 1880 году здесь в одной из квартир поселился руководитель военной организации партии «Народная воля». После убийства императора Александра II в 1881 году он был арестован. В доме № 70 в 90-е годы проживал известный архитектор А.И. фон Гоген, по проекту которого построены особняк Кшесинской и здание музея Суворова. В конце XIX века на участке, где ныне располагается дом № 7, была возведена Троицкая церковь.
В начале XX века на нынешней улице Марата также произошло немало интересных событий и фактов. Например, из одной из квартир дома № 37 был выпущен в свет первый номер газеты «Правда». В доме № 9 жил выдающийся петербургский композитор Д. Шостакович, а в здании под номером 58 действовал популярный театр того времени – «Синяя птица».
После революции улицу переименовывают в честь французского революционера Жан-Поля Марата. После Великой Отечественной войны улицу Марата продлевают через Семеновский плац до Подъездного переулка. В семидесятые годы XX века на месте снесенной Троицкой церкви возвели здание общественной бани. Сегодня улица Марата является достаточно престижной магистралью Петербурга – здесь расположены генеральные консульства Швейцарии, Венгрии и др.
В 2006 году на перекрестке улиц Марата и Звенигородской открылся первый в России океанариум. Общая площадь океанариума около пяти тысяч квадратных метров. Здесь получили постоянное место жительство более ста двадцати видов рыб из разных уголков мира.
