История Севастополя является отражением истории его порта. В 1802 г. Севастополь вошёл в состав Таврической губернии, а позже объявлен главным военным портом Чёрного моря Российской Империи. Сам город, изначально задуманный как военное поселение при морской крепости, рос и развивался исключительно благодаря военному порту.
Севастополь, изначально задуманный как военное поселение при морской крепости, рос и развивался исключительно благодаря военному порту, однако его уникальные бухты были чрезвычайно привлекательны не только для военных кораблей, но и для торгового мореплавания. Уже через два года после появления в Севастопольской гавани первых судов, в начале 1784 г. одновременно с распоряжением о строительстве адмиралтейства, большой крепости и порта было объявлено о свободной торговле местных и заграничных купцов, привозивших свои товары как морским, так и сухопутным транспортом. Вместе с военным начал расти и торговый порт.
В периоды военных действий на Черном и Средиземном морях (1787-1791, 1798-1799) торговые функции порта приостанавливались. С 1804 г., когда Севастополь был объявлен главным портом Черноморского флота, до 1867 г. торговый порт в Севастополе как международный не функционировал, но оставался открытым для купеческих судов России.
В 1867 г., когда окончилась Крымская война, военный порт в Севастополе был упразднен и в городе появился Международный торговый порт. В город опять стали приходить суда под турецкими, греческими, английскими, итальянскими, норвежскими флагами. Началась международная торговля.
В 1868 г. Севастопольский морской торговый порт посетило 498 судов, в том числе 51 под иностранными флагами. Расширялся список портов мира, с которыми активно сотрудничал Севастополь. Севастопольский порт начал оказывать решающее влияние на развитие города.
В 1875 г. к Севастополю была проведена железная дорога, и с ее пуском Севастополь был официально объявлен отпускным (экспортным) коммерческим портом. Были установлены регулярные рейсы пароходов в Константинополь. Севастопольский морской торговый порт активно сообщался с американскими портами Нью-Орлеаном, Чарльстоном, Гальвстоном, европейскими - Неаполем, Генуей, Ливорно, Венецией, Тарагоной, Пиреем, Шербургом, Ниццей, Мальтой, египетскими - Александрией и Порт-Саидом.
С 1885 г. вновь встал вопрос о месте размещения торгового порта. К тому времени все поняли его жизненную необходимость для нормального развития Севастополя.
В первую мировую войну гражданские суда составляли транспортный флот в составе Черноморского флота на черноморском театре военных действий. В 1919 г. эти суда были частично возвращены владельцам. Часть судов была мобилизована для эмиграции белой армии из Севастополя и уведена в Бизерту.
Советский период деятельности Севастопольского порта начинается со второй половины ноября 1920 г. Гражданская война и послевоенная разруха оставили тяжелое наследство, но как и в большинство переходных периодов, в городе возрождается торговый порт, который активно участвует во внешней торговле.
Во время Великой Отечественной войны грузопассажирские суда были приписаны к военно-морскому флоту. Деятельность Севастопольского торгового порта снова была прервана, морской вокзал в Севастополе был разрушен. Севастополь, имея огромный потенциал для развития морского порта, на протяжении практически всей своей истории развивался преимущественно как военно-морская база.
После освобождения города Севастопольский порт возобновил свою деятельность как трест «Горпароходство» севастопольского городского коммунального хозяйства. В 1944 г. трест переименовали в Севастопольское агентство Черноморского государственного морского пароходства и приняли на баланс Черноморского пароходства. В 1962 г. Севастопольское агентство было реорганизовано в Севастопольский морской торговый порт.
В 1968 г. было введено в эксплуатацию новое здание морского вокзала, в 1970-м было закончено строительство пассажирского причала в Артбухте, построен причал ГРЭС. В 1981 г. введен в строй причал грузового района, появилась дополнительная возможность заниматься грузопереработкой. В 1983 г. построен еще один пассажирский причал в Артбухте. В 1984 г. в портофлоте насчитывалось 37 пассажирских катеров, 3 парома, 7 единиц служебно-вспомогательного флота.
В начале и в середине 90-х гг. порт переживал сложное время: сменился экономический уклад общества, обострились кризисные явления, связанные с образованием СНГ, необходимо было выбирать новые приоритеты, искать пути выживания и дальнейшего развития. Положение усугублялось тем, что с 1992-го по 1997 год порт находился в коммунальной собственности. С середины 1993 г. Севастополь открылся для международных пассажирских и грузовых перевозок. Это дает порту возможность развивать как грузопереработку, в том числе транзитную, так и прием иностранных круизных и туристических судов. Распоряжением Кабинета министров Украины в 1996 г. в Севастопольском порту был открыт пункт пропуска через государственную границу Украины для международного сообщения с правом захода иностранных невоенных судов.
В 1997 г. порт получил статус международного и развивается сейчас в соответствии с этим статусом. За последние годы порт принял более 100 туристических круизных судов. Это крупнотоннажные высокобортные суда с условным объемом от 50 до 95 тыс. м3, длиной от 180 м до 240 м - такие как «Silver», «Wistafjord» или «Europa», а также суда типа «река - море» АСК «Укрречфлот» с иностранными туристами на борту.
