В Ираклионе находится исторический музей Крита, где представлены исторические документы, начиная с пост-византийского периода и вплоть до наших дней. Коллекция включает находки византийского и венецианского периода правления на Крите, скульптуры, а также документы времён турецкого владычества на острове.
Пожалуй, самой примечательной частью исторического музея являются работы критских иконописцев Доменикоса Теотокопулоса (известного в Европе под псевдонимом Эль Греко), Михаила Дамаскиноса, Теофаниса и Георгиоса Клонтзаса.