На крайнем юге Кюсю вечнозеленые субтропические леса поднимаются в горы почти до 1000 м, а на уровне моря появляется типичный тропический лес. Тропические леса одевают также острова Рюкю до высоты примерно 300-500 м. Они сочетаются с полями риса, плантациями батата и сахарного тростника.
Небольшой остров Яку, находящийся в 60 км к югу от полуострова Осу-ми, знаменит не только тем, что это самое «мокрое» место в Японии, но и тем, что здесь сохранился криптомериевый лес, возраст деревьев в котором достигает 3000 лет. Расположенный на острове биосферный заповедник Якусима с действующими вулканами, горячими источниками, редкими и эндемичными видами животных включен ЮНЕСКО в Список всемирного культурного и природного наследия.
Большую часть острова покрывает тропический лес. Распостранено дерево суги (яку-суги, Cryptomeria japonica). Богатая фауна включающая оленей и обезьян, живописные горы и водопады, термальные источники привлекают на остров до 300 тысяч туристов в год.
