С разрешения Святейшего Синода в 1828 году была заложена Михайло-Архангельская церковь. По кокончании строительства в 1833 году, церковь имела два придела: во имя св. Пророка Илии и во имя иконы Божией Матери Феодоровской. До 1841 года в Херсонско-Таврической епархии действовали четыре мужских монастыря и ни одного женского.
В 1841 году при церкви с Высочайшего разрешения был учрежден женский монастырь 3-го класса с целью "воспитания и образования сирот женского пола духовного звания". Строительство монастыря осуществлялось при содействии одесских негоциантов. Особо много забот по устройству монастыря и монастырского подворья на Среднем Фонтане уделял известный политик, религиозный писатель и философ Александр Скарлатович Стурдза.
Торжественное освящение - состоялось 9 мая, по старому стилю, 1844 года. При ощежительном монастыре был открыт сировоспитательный приют для круглых сирот духовного звания, позже преобразованный в Епархиальное женское училище.Учащихся девиц- сирот на то время состояло не менее 60, которые получали в училище хорошее образование. Председателем Попечительского совета училища состоял профессор Новороссийского (Одесского) университета протоиерей Михаил Карпович Павловский. С тех пор монастырь стал очагом благотворительности, милосердия и духовности, а в дальнейшем прославился иконописью, шитьем риз.
Возрождение Архангело-Михайловского женского монастыря началось в 1991 году, когда, 4 декабря, был зарегистрирован его устав. В апреле 1993 года монастырю возвратили часть сохранившихся помещений, в которых располагалась туберкулезная больница и с 1 мая начались богослужения в открытом Архангело-Михайловском храме.
Под руководством настоятельницы обители игуменьи Серафимы монастырь превратился в настоящий православный и культурный центр в Одессе. На его территории возведен монастырский приют - современное здание Дома Милосердия, построена часовня, Музей «Христианская Одесса». С разрешения Святейшего Синода в 1828 году в Одессе была заложена Михайло-Архангельская церковь. При этой церкви в 1841 году с Высочайшего разрешения был учрежден женский монастырь 3-го класса с целью "воспитания и образования сирот женского пола духовного звания". Строительство монастыря осуществлялось при содействии одесских негоциантов. Торжественное освящение состоялось 9 мая (по старому стилю) 1844 года. Учащихся девиц- сирот на то время в Сировоспитательном заведении состояло не менее 60. С тех пор монастырь на долгие годы стал очагом благотворительности, милосердия и духовности, в дальнейшем прославился иконописью, шитьем риз. Позже Сироваоспитательное училище при монастыре было преобразовано в Епархиальное женское училище, одно из лучших образовательных заведений города.
В 1923 году монастырь был закрыт, а в 1931 году его Архангело-Михайловский собор взорван. В апреле 1993 года монастырю возвратили часть сохранившихся помещений, в которых располагалась туберкулезная больница и началось новое возрождение обители под руководством настоятельницы игуменьи Серафимы. На территории монастыря возведен монастырский приют - современное здание Дома Милосердия, построены часовня и музей "Христианская Одесса"