Францисканский монастырь Непорочного зачатия (Monasterio de la Concepción Franciscana) расположен в квартале Сан Франсиско, рядом с чертой старого города, в 500 м к юго-западу от собора.
Монастырь был основан в 1504 году на месте старых сооружений тамплиеров, но его здания относятся к более позднему периоду. Фасады трех ярусов почти ничем не украшены — лишь небольшими окнами, размещенными безо всякой симметрии, и гербами своего основателя. Входной портал — плоский с небольшим рельефом, выполнен Педро де Альвисом в стиле платереско и украшен изображением ангелочков и скульптурой Девы Марии. Портал венчается фигурой, которая, судя по черепу рядом, является аллегорией смерти.
В 18 веке церковь была перестроена, внутренние опоры стесаны, и устроен эллиптический купол. Интерьер оформлен в стиле рококо.