Строительство в Евпатории синагоги Егия-Капай было начато в 1911 году. В 1912 году синагога была торжественно освящена и открыта для прихожан. Здание построено в форме базилики из мамайского желтого известняка с чередованием широких и узких рядов и швами в виде правильной перевязи. Вход в синагогу находится с западной части и соответственно алтарь ориентирован на Иерусалим. На верху здания находится большое круглое окно с витражом, на нем изображена шестиконечная звезда, а над ней библейские символы: жертвенный треножник, поставленный Моисеем на горе Синай и стилизованное изображение Ковчега с высеченными Десятью заповедями на скрижалях.
Внутреннее помещение синагоги делится на три нефа металлическими столбами в два ряда. Над боковыми нефами находились хоры. Центральный неф с двухскатной кровлей выступал вперед, по бокам кровли были расположены круглые окна. Карнизы трех нефов украшены пояском в виде небольших арок, а над каждым из трех входов переброшены стреловидные арки, выступающие за пределы стен. Нижние боковые окна синагоги были прямоугольные с перекрытием в виде клина.
После распада Советского Союза здание синагоги было возвращено еврейской общине. После длительных реставрационных работ в августе 2003 года синагога Егия-Капай была освящена во второй раз. Храм вернули верующим.
Для желающих осмотреть храм и узнать его историю, в синагоге организованы экскурсии.