Усадьба Алтуфьево и прилегающая к ней церковь Воздвижения Господня представляют собой мемориальный комплекс архитектуры усадебного типа XVIII—XIX веков. Первое упоминание о деревне Алтуфьево появилось еще в 1585 году. В это время она находилась во владении Н.Д. Мякишева. Однако уже в 1678 году на территории деревни была построена Крестовоздвиженская церковь, благодаря которой деревня получила свое второе название – Воздвиженское.
За все время своего существования усадьба сменила несколько владельцев и претерпела значительные изменения. Так, в 1760-е годы владельцем усадьбы стал И. И. Вельяминов, который отстроил господский дом с тринадцатью комнатами, выдержанный в стиле барокко (1767), парк с двумя прудами и каменный храм.
В это время в центральной части дома был построен деревянный мезонин с шатровым «бельведером». Южный фасад дома украсили белокаменные колонны и особые килевидные украшения для окон и входного тамбура. Дом был вновь реконструирован на рубеже 19-20 веков, и усадьба потеряла свою башню-бельведер. Последним владельцем усадьбы (до 1917 года) был нефтяной промышленник Лианозов, в честь семьи которого, и назван район места расположения усадьбы.
В настоящий момент музей-усадьба Алтуфьево располагается в районе бывшего имения Лианозово, к западу от Алтуфьевского шоссе. Общая площадь владения составляет около 10,3 га.
Основными архитектурными памятниками культурного наследия, размещенными на территории владения Алтуфьево являются: Господский дом, церковь Воздвиженья Креста Господня (1760-1763гг.) пивоварня и парк.
Церковь воздвижения Креста Господня, построенная в 1760—1763 также претерпела значительные изменения. Если в момент постройки церковь имела круглый основной объем диаметром около 12 м, с восьмигранным верхним ярусом и колокольней, то в ходе реконструкции 1993-1995 годов церковь лишилась старой колокольни (ее место занял световой барабан). Тем самым церковь утратила часть своей исторической ценности. В ходе реконструкции площадь церкви увеличилась в 2,5 раза и своей площадью полностью закрыла вид на усадьбу - красивое здание середины XVIII века, оформленное в стиле барокко.
На данный момент усадьбу вместе с флигелем передали приходу храма, послушники которого по мере возможности проводят реставрационные работы.