В Национальном военном музее представлены экспонаты, иллюстрирующие важную военную роль, которую играла Мальта в период после 1800 года, под управлением Британии, особенно в годы второй мировой войны.
Характерной особенность этой экспозиции являются фотоснимки большого формата, изображающие тяготы, выпавшие на долю гражданского населения, а также масштаб нанесенных войной разрушений в 1940-1943 годах.
Определенно заслуживают внимания престижные награды и знаки отличия, полученные мальтийскими военными и гражданскими лицами во время второй мировой войны за храбрость и самопожертвование.
Левое крыло музея посвящено в основном Королевскому военно-морскому флоту: здесь выставлены различные мундиры, знаки отличия, обмундирование, мальтийские конвои, фрагмент истребителя Spitfire, двигатель Junkers Juno, крыло, пропеллеры, боеприпасы, инструменты с самолета Messerschmitt, а также реликвии и изобразительные материалы, относящиеся ко временам налетов гитлеровской Германии и ее союзников.
