Театр построен в 1767 – 1769 годах по проекту архитектора Антонио Бибиены, в стиле барокко, в интерьере с четырьмя ярусами полуциркульных лож, ограниченных колоннами. Театр был торжественно открыт 3 декабря 1769 года исполнением «Вергилия и Манто» Луиджи Гатти. Он был назван «Научным Театром», поскольку здесь, помимо спектаклей, должен были проводиться совещания, диспуты и прочие научные мероприятия, в соответствии с просветительским духом эпохи.
Через несколько недель после открытия, 16 января 1770 года, в театре с концертом выступил 14-летний Моцарт. После концерта зал театра и само сооружение удостоилось похвалы отца великого композитора и музыканта Леопольда.
И в настоящее время в театре проводятся музыкальные концерты самого высокого уровня. В последние годы Научный театр приобрел особое значение, так как именно там проводятся важнейшие мероприятия Литературного фестиваля Festivaletteratura.
Театр находится на улице Via Accademia, в нескольких десятках метров к югу от комплекса Палаццо Дукале.