Церковь святого Стефана находится недалеко от Площади коммуны (piazza del Comune), вверх по via San Paolo, приблизительно в 400 м северо-западнее кафедрального собора Ассизи.
Церковь была возведена в 12-13 веках. Здание не было затронуто перестройками, оно практически полностью сохранило свой оригинальный облик.
Местное предание гласит, что колокола этой церкви беспрерывно звонили, когда святой Франциск прощался с жизнью.