Церковь расположена на одноимённой площади piazza San Francesco d’Assisi, примерно в 1,1 км от собора Палермо в направлении моря, недалеко от известного рынка Вуччирия.
Церковь святого Франциска Ассизского была построена в 1255 - 1277 годах для монастырского комплекса, находившегося в богатом торгово-ремесленном квартале Палермо. Ранее на том же месте стояла другая церковь, разрушенная при Фридрихе II в 1240 году. Церковь святого Франциска много раз перестраивалась. В 14 - 15 веках были построены порталы и капеллы в готическом стиле и стиле эпохи Возрождения. В эпоху барокко храм был украшен работами Пьетро Новелли и Джакомо Серпотты.
В настоящее время храм является действующей церковью, где 8 декабря происходит религиозный обряд перед изображением Непорочной Девы: глава города преподносит традиционный дар – тридцать серебряных скудо, даёт клятву верности и просит Деву Марию защищать весь город.
Церковь построена по базиликальному плану. Фасад, отреставрированный Патриколо, выполнен в позднероманском стиле с готическим порталом, над которым возвышается розетка.
Внутреннее пространство разделено на три нефа. Стрельчатые арки поднимаются над пилястрами, образуя готический свод. 16 капелл церкви украшены работами известных мастеров.
В капелле святого Иосифа можно полюбоваться горельефом, изображающим святого Георгия, поражающего дракона, работы Антонелло Гаджини (1526). Капелла Непорочной Девы отделана разноцветным мрамором (18 век), в капелле хранится почитаемая статуя Девы Марии. В капелле 14 века находится саркофаг Атаназио Спечале работы Доменико Гаджини или Франческо Лаураны (мнения исследователей расходятся). Интересна капелла Мастрантонио работы Лаураны (1468) – застывший пример того, как эпоха Возрождения ворвалась в позднюю сицилийскую готику.
Центральный неф украшают 10 аллегорических статуй, представляющих францисканские добродетели, резца Джакомо Серпотты (1723). Среди них: Кротость с ангелом; Правосудие с обнажённой турецкой саблей, Скромность, отводящая взгляд от зеркала. В храме сохранились деревянные хоры. Интересна коллекция деревянных статуй и картин 16 века в Сокровищнице храма. В церкви также хранится перенесённая со стены на полотно фреска Новелли «Святой Франциск и двое святых» и работы Гаджини.