Церковь святого Вильгельма находится на улице Кальвина (Rue Calvin) примерно в километре к востоку от кафедрального собора Страсбурга. Она является единственным сохранившимся элементом монастыря, построенного в начале 14 века для нищенствующего монашеского ордена святого Вильгельма. Предание гласит, что церковь построена рыцарем Генрихом фон Мюлленхаймом, сопровождавшим Людовика Святого в крестовом походе, в ходе которого он дал обет построить церковь в случае, если вернется домой невредимым.
Строительство закончилось в 1307 году, и с тех пор постройка практически не изменяла своего внешнего вида. Однонефная церковь в готическом стиле, крайне лаконичная в своем внешнем виде, без каких-либо украшений на фасаде прекрасно отвечала аскетическим идеалам нищенствующего ордена. В середине 16 века католический монастырь приходит в упадок из-за набирающей обороты в Страсбурге Реформации. В 1553 году монастырь закрывается, и церковь святого Вильгельма с тех пор принадлежит одному из семи лютеранских приходов Страсбурга. После того, как церковь стала приходской, была надстроена колокольня: для этого архитектор объединил три щипца, которыми оканчивался фасад, в один и завершил фасад башней со шпилем.
Церковь святого Вильгельма и все элементы ее интерьера занесены в список исторических памятников с 1987 года.