Эстонский Исторический Музей начал зарождаться в 19-ом веке, когда внезапно в стране возрос интерес к национальной истории. Самый первый частный музей в Эстонии вырос из небольшой коллекции. Сотрудник таллиннского муниципалитета Йоханн Бурхарт в свободное время занимался собиранием древностей. Его коллекция Mon Faible (моя слабость) была основана в 1802-ом году. Сегодня она является одним из самых интересных разделов современного музея.
Считается, что музей, как таковой был основан в 1842-ом году, когда было создано Эстонское Литературное Общество. Целью Общества было "изучение родины во всех ее проявлениях, через ее историю, искусство, производство, технологии и природу". Создатели Общества считали, что музей является одним из необходимых средств для достижения поставленных задач. Коллекция, основанная на частных собраниях и пожертвованиях, постепенно стала разрастаться и было решено разместить ее в местном провинциальном музее.
Во времена эстонской республики (1918-1940) музей сохранял свою позицию. Коллекция продолжала расти, во многом благодаря балтийским и немецким ученым. Прежде всего, пополнялись археологические собрания, но число материалов по естественным наукам, архивных документов и культурных памятников, материалов по естественным наукам также продолжало расти.
В 1940-ом году, когда Эстония вошла в состав Советского Союза, с музеем произошли большие изменения. Прежде всего, музей был национализирован и переименован в Государственный Исторический Музей Эстонской ЭССР. Многие коллекции были перенесены в другие музеи. Часть собрания музея стала базой для других музея, в частности Музея Естественных Наук. В послевоенные годы в музее незаконно было проведена ликвидация так называемых "вредных материалов" - то есть всего, что было связано с историей независимой Эстонии. Но кое-какие важные материалы, к счастью сохранились, благодаря энтузиазму кураторов и хранителей музея.
Адрес: Пикк 17