Геологический Музей был открыт в 1772 году и назывался тогда «Новый Университетский Музей Естествознания». Музей содержит экспонаты, собранные на протяжении 300 лет. После своего образования музей представлял собой Геологическое учреждение и был главной частью с «Геологического Обзора Дании» (1888) и Гренландии (1946), а также четырех геологических институтов (1967), которые впоследствии объединились в «Геологический Отдел» Копенгагенского Университета (1991).
В настоящее время Геологический Музей является центром датской геологии. По посещаемости он занимает первое место в Дании. Музей поддерживает и расширяет научные коллекции, ведет исследования в области геологии, представляет научную геологию на всех культурных мероприятиях и собраниях. Также музей стремится поддержать интерес, к геологии устраивая временные выставки.
Музей состоит из шести главных коллекций, представляющих геологические ветви, библиотеки, которая обслуживает геологический Институт и «Геологический Обзор» Дании и Гренландии, а также Центра Литосферы. В собрании музея около 8.000.000 экспонатов. Также в музее 30 больших королевских и частных коллекций. Все коллекции разделены на две главные категории: первая это каменные породы, которые образуют основу научных исследований; вторая это основная коллекция, которая создана для документирования развития различных регионов земли в особенности Дании, Фарельских островов и Гренландии, а также иллюстрировать развитие флоры и фауны на протяжении веков.