История многих памятников начинается с деревянных построек, особенно, если речь идет о древнейших достопримечательностях. Многие из них с годами перестраивались и благодаря этому смогли сохраниться и до нашего времени. так в десятом столетии вместо современной церкви Богоматери в Орхусе находилась деревянная церковь, которая была полностью уничтожена пожаром.
В одиннадцатом веке духовенство страны было очень сильно взволновано постоянным вмешательством епископа Бременского во все внутренние дела Дании. И уже в 1060 году Свенд Эстридсен предложил очень непростое решение проблемы: поделить Данию на восемь епархий. Таким образом, он становится самым первым епископом в Орхусе.
С момента своего основания церковь претерпевала очень много различных реформаций и реконструкций. Самые последние изменения и реставрации проводились еще в 2000 году. После этого ее освятили и теперь она известна, как церковь Святого Николая, но многие все же предпочитают называть ее церковью Богоматери.